《表1 Csa-miR171a、Csa-miR171b、Csa-miR171c、Csa-miR171d克隆引物列表》

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《黄瓜microRNA171的克隆与功能分析》


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根据前期‘北京截头’叶片非编码小RNAs测序结果,筛选获得4个高表达、高质量的Csa-miR171成熟序列和前体序列,将筛选到的Csa-miR171前体序列比对到黄瓜基因组数据库(http://cucurbitgenomics.org/),获得具有高效表达的Csa-miR171前体侧翼序列(Csa-miR171前体序列上、下游各延伸100~150 bp),采用primer 6软件进行引物设计(表1),以黄瓜DNA为模板进行PCR扩增,得到Csa-miR171a、Csa-miR171b、Csa-miR171c、Csa-miR171d完整的4个前体序列。将Csa-miR171前体的PCR产物与pMD19-T载体连接,转DH5α感受态细胞,采用氨苄青霉素(AMP)抗性筛选阳性菌落,PCR鉴定阳性克隆送至公司(南京擎科生物科技有限公司)测序鉴定。