《表1 S0能源底物下差异蛋白斑点的MALDI-TOF/TOF鉴定结果》

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《Acidianus manzaensis菌硫氧化相关膜蛋白基因的筛选及鉴定》


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注:“*”表示富含巯基和含有一个及以上—CXXC—功能域。

通过比较蛋白质组学方法筛选的A.manzaensis菌与S0氧化相关的膜蛋白斑点经过胶内酶切,再进行MALDI-TOF/TOF分析和对应膜蛋白的肽指纹图谱鉴定,结果如表1所示。由表可知:挖取的10个膜蛋白斑点只鉴定了8个(吡啶核苷酸-二硫键氧化还原酶、Rieske铁硫蛋白Sox L2、Ten A家族的转录激活因子、赤鲜素蛋白以及2个假定蛋白),其原因是4号和5号膜蛋白斑点为过氧化物酶,6号和7号膜蛋白斑点为乙/丙酰辅酶A羧化酶,这表明上述2种膜蛋白有不同的构象异构体存在,构象异构体的差异导致了等电点的轻微不同,即斑点等电点位置发生漂移;对鉴定的膜蛋白进行亚细胞定位预测发现,通过筛选得到的与S0氧化相关的膜蛋白大部分位于细胞膜,其中2个假定蛋白和转录激活蛋白(Ten A家族)预测为未知的亚细胞定位,这说明筛选鉴定得到的膜蛋白与采用温度诱导的Triton X-114两相分离萃取技术提取的膜蛋白基本吻合;对鉴定的膜蛋白序列进行分析可知,8号斑点所对应的未知功能的膜蛋白富含巯基(—SH)且含有一个及以上的—CXXC—功能域。