《表2 植物circRNAs鉴定》

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《非编码RNA在植物中的研究进展》


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SANGER等[64]于20世纪70年代在植物病毒体中发现了第1个circRNAs。2014年在拟南芥根部首次发现circRNAs,随后2016年YE等[65]补充报道了水稻中有12 307个circRNAs,模式植物拟南芥中有6 012个circRNAs(表2)。2015年,LU等[66]通过高通量测序和RNA-seq数据的生物信息学计算后,在水稻中鉴定了2 354个circRNAs,其中1 356是外显子来源的circRNAs,一些差异表达的circRNAs表现出组织特异性。LIU等[67]对不同生长阶段的拟南芥叶片进行转录组测序,通过对拟南芥叶片生长与衰老过程的表达谱进行分析,鉴定了168个circRNAs,其中包括40种新型circRNAs,在拟南芥叶片中有158个是基因外显子来源的circRNAs。通过GO分析和KEGG分析,一些circRNAs被注释,从中发现circRNAs具有调控拟南芥叶片衰老的功能。