《表5 基因库下载的金线莲及其混伪品的DNA条形码》

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《筛选金线莲种质资源的通用DNA条形码序列及鉴定其混伪品》

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利用CodonCode Aligner 5.1.2软件对测序峰图文件进行校对和突变检测等，去除低质量引物区及序列。利用DNAMAN和Mega 6.0软件包进行序列拼接和序列比对分析，同时对部分序列手动调整。为了分析所选的DNA条形码在大数据基础上的分辨能力，我们从NCBI基因库下载了金线莲及其混伪品的ITS、rbcL、matK、psbA-trnH序列共29条（表5）。对所有序列通过Mega 6.0软件的K2P模型进行双重比对和完全序列比对，计算遗传距离值并比较分析不同序列种内和种间变异，建立Neighbor Joining（NJ）系统树计算评价鉴定效果。