《表2 RNASeq Map统计》

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《利用转录组测序筛选低切应力作用下人脐静脉内皮细胞的差异表达基因》

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以Ensembl数据库来源的基因为参考基因，统计了19986个基因，并从不同的数据库中整理该物种的注释信息。获得了基因的编号（ENSEMBL ID），染色体上位点信息，基因的命名（HGVS Symbol、NCBI Gene ID、UniProtKB ID），基因的分类（GO、KO、EC分类），基因的文字注释信息。以Burrows-Wheeler Transform算法为基因组序列建立索引，使用全局比对法将过滤后的短序列与基因组进行比较，得到序列的来源基因及其表达产物的结构。结果显示，所有样本中比对上参考基因组的序列占91%以上，其中只比对到一个位置的序列占97%，而比对到基因区域的Reads占95%以上，其中比对到外显子区域的Reads占94%以上（表2）。