《表2 沙门菌七对管家基因的引物序列》
(1) MLST引物设计:参考MLST官方网站(http://mlst.Warwi ck.ac.uk/mlst/dbs/Senterica)上公布的七对管家基因的片段序列(aroC,dnaN,hemD,hisD,purE,sucA,thrA),并由睿博兴科生物技术有限公司合成所需引物。引物序列见表2。(2)细菌DNA的提取:参考细菌基因组DNA提取试剂盒说明书提取沙门菌分离株的DNA。(3) PCR反应条件:PCR扩增体系为50μl,其中2×PCR Master Mix(含有2×Taq DNA聚合酶、2×PCR Buffer和2×dNTP)25μl、DNA模板2μl、上下游引物(10pmol/μl)各2μl、ddH2O 19μl。反应程序:94℃5min(预变性),94℃45s,55℃45s(退火),72℃1min,共35个循环,72℃7min(延伸),4℃结束。(4) PCR产物纯化:将PCR产物全部用于电泳检测,用1%琼脂糖凝胶电泳,电压120V,电泳45min,以DNA Marker DL2000为参照用凝胶成像仪成像观察,并将有目的片段的琼脂凝胶切下,装到预先准备好的离心管中,然后参考胶回收试剂盒说明书继续PCR产物的纯化。(5)测序及结果分析:将上述纯化后的PCR产物交于上海生物工程技术有限公司进行测序。下载沙门菌管家基因全部数据库,然后建立本地数据库,对测序结果剪切后进行序列比对,记录七对管家基因的等位基因数值,然后通过Pub MLST网站查询ST型。
图表编号 | XD0055109800 严禁用于非法目的 |
---|---|
绘制时间 | 2019.08.01 |
作者 | 张富友、宋艳、崔治中、孙淑红 |
绘制单位 | 山东农业大学动物科技学院、山东农业大学动物科技学院、山东农业大学动物科技学院、山东农业大学动物科技学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |