《表2 SSR位点的多样性指数》
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《不同来源中国李(Prunus salicina L.)的多样性与近缘种关系》
SSR位点、连锁群和位置均来自于Prunus属参照图谱(T×E图谱)的信息,具体参见DIRLEWANGER等[17],位点后文献序号是该位点引物信息来源。Ao:总等位变异数;Ne:有效等位变异数;I:Shannon’s指数;Ho:观察杂合度;He:期望杂合度;F:Wright’s固定系数;Nm:基因流。下同The locus,lin
本研究中,参照SCHUELKE等[16]设计带有M13接头的SSR引物(Tailed primer M13 microsatellite markers,TP-M13-SSR):即正向引物的3′末端增加一段序列为TGTAAAACGACGGCCAGT的接头引物;反向引物序列不变。22对SSR引物均来自Prunus属公共图谱不同染色体上,具体信息见表2。PCR反应采用20μL反应体系,其中DNA模板5μL、2×Taq Master Mix(北京康为世纪生物公司)10μL、带M13接头的正向引物0.4μL、通用M13荧光引物1.6μL、反向引物2μL。PCR扩增反应程序如下:在95℃下解链5 min;整个PCR反应共40个循环,前15个循环为94℃45 s,55℃45 s,72℃45 s,后25个循环为94℃45 s,52℃45 s,72℃45 s;最后,在72℃下延伸10 min,保存于4℃。
图表编号 | XD0048697700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.02.01 |
作者 | 魏潇、章秋平、刘宁、张玉萍、徐铭、刘硕、张玉君、马小雪、刘威生 |
绘制单位 | 辽宁省果树科学研究所、辽宁省果树科学研究所、辽宁省果树科学研究所、辽宁省果树科学研究所、辽宁省果树科学研究所、辽宁省果树科学研究所、辽宁省果树科学研究所、辽宁省果树科学研究所、辽宁省果树科学研究所 |
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