《表3 改良MLVF、MLVA与PFGE三种方法型/群之间一致性分析》

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《改良MLVF与MLVA及PFGE对医院流行耐甲氧西林金黄色葡萄球菌分型研究》


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注:a.M-MLVF,改良MLVF;PFGE分群定义为经UPGMA方法统计,采用84%为cutoff值;改良MLVF分群定义为经UPGMA方法统计,采取相似性指数0.9为cutoff值。

三种方法在分型水平上总体一致性均较低(AR指数<0.5),而在分群水平上较高(0.989,0.765,0.755)。总体一致性比较显示,改良MLVF与PFGE在群水平上AR指数达到0.989,高于MLVA与PFGE群水平一致性0.765。Wallace一致性分析显示,改良MLVF同一型别的菌株经PFGE分型也属于同一PFGE群(Wallace指数1.000)。而MLVA同一型别的菌株不都属于同一PFGE群(Wallace指数0.805)。改良MLVF与MLVA之间也不能完全预测彼此型别和分群的归属(Wallace指数<1.000)。部分代表型菌株以PFGE同源性聚类见图1。图中所示,PFGE同一群的菌株也被分在同一改良MLVF型中,但PFGE A群和B群(分别为ST239-spat030型和ST239-spat037型)却都被分在ML-VA A群中。PFGE与改良MLVF、MLVA之间亚型的一致性较低。改良MLVF、MLVA与PFGE三种方法在分型和分群水平之间一致性比较见表3。