《表1 miR-127-3p过表达与对照组细胞间的差异表达基因》
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《miR-127-3p对C2C12细胞成肌分化和转录组的影响》
为了进一步鉴定受miR-127-3p调控的转录因子,将差异表达基因(表1)与TFCat数据库进行匹配,结果发现2个转录因子,即Irf7和Ddit3。这暗示转录因子Irf7和Ddit3表达的变化可引起下游多个受其调控的靶基因表达变化,进而导致处理组与对照组的细胞表型变化。为了进一步确定miRNA与潜在的靶基因之间是否存在直接碱基配对关系,对miR-127-3p与Ddit3基因序列进行比对分析,发现miR-127-3p与Ddit3基因的蛋白编码区(CDS)存在碱基互补配对关系(图5),暗示miR-127-3p可能通过碱基配对的方式影响Ddit3基因的表达。同时,该结果有助于完善miR-127-3p的成肌分化调控轴(图6),miR-127-3p与Ddit3基因的关系还需进一步试验验证。
图表编号 | XD0043983700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.01.25 |
作者 | 宋天增、李杰、马金英、蒋婧、王高富、付琳、周鹏、马友记、任航行 |
绘制单位 | 西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所、重庆市畜牧科学院草食牲畜研究所、西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所、重庆市畜牧科学院草食牲畜研究所、重庆市畜牧科学院草食牲畜研究所、重庆市畜牧科学院草食牲畜研究所、重庆市畜牧科学院草食牲畜研究所、甘肃农业大学动物科学技术学院、重庆市畜牧科学院草食牲畜研究所 |
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