《表2.氨基酸代谢通路的KEGG富集分析》
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《RNA-Seq揭示Foc4在外源氧化胁迫(H_2O_2)下的基因表达及细胞代谢变化》
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为了验证RNA-Seq实验结果,选择了其中12个基因进行qRT-PCR分析。包括9个表达上调的基因,分别为3个谷胱甘肽S转移酶编码基因,其RNA-Seq测序编号/编码蛋白的GenBank登录号分别为c5762/EXL96709.1、c6215/EMT69530.1和c9910/EMT62696.1;2个过氧化氢酶编码基因c1575/AFH74421.1和c8420/AFH74418.1;3个转录因子编码基因c12019/EMT67964.1、c744/EMT69978.1、c1898/EXM02846.1;1个热休克蛋白c6716/EMT74020.1。也随机选取了3个在氧化胁迫条件下表达没有明显变化的基因,即一个AMP结合酶编码基因c1001/EMT63995.1、1个蛋白酶转录激活因子partT编码基因c13946/EXM07552.1和1个α-D-木糖苷甲氧基水解酶编码基因c5104/EXM08950.1。qRT-PCR验证结果如图3所示,这些基因的差异表达情况与RNA-Seq实验结果类似。
图表编号 | XD0043802400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.05.04 |
作者 | 齐兴柱、刘磊、汪军 |
绘制单位 | 海南大学热带生物资源教育部重点实验室、海南大学海洋学院、中国热带农业科学院环境与植物保护研究所、中国热带农业科学院环境与植物保护研究所 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |