《Table 2 Feature comparison between SpliceMap and LNCediting database表2 SpliceMap和LNCediting数据库的特征比较

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《lncRNA选择性剪接调控的研究进展》


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SpliceMap较LNCediting数据库创建的早，且收录的物种较全面，可制作基因组和转录组数据剪接位点的比较图，并利用MaxEntScan评分来评估剪接位点的守恒率.预测蛋白质编码剪接位点的保守性表明了该方法的特异性且剪接位点的保守性，为保守的lncRNAs数量提供了下限值.而LNCediting数据库则是通过收集lncRNA转录本中的RNA编辑位点数据，使用两种定制工具（预测RNA编辑位点分别对lncRNA结构以及miRNA-lncRNA相互作用的影响）来预测RNA编辑在lncRNA中的功能效应.这两个lncRNA选择性剪接数据库是根据不同层面创建的，SpliceMap主要用于查询，而LNCediting则主要用于功能预测.所以，两者具有不同的研究用途.

图表编号XD0040370500    严禁用于非法目的
绘制时间2019.02.20
作者季慧慧、赵永杰、郑中华、段世伟
绘制单位宁波大学医学院浙江省病理生理学技术研究重点实验室、新疆医科大学第一附属医院老年病科、宁波大学医学院浙江省病理生理学技术研究重点实验室、宁波大学医学院浙江省病理生理学技术研究重点实验室
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