《Table 1 The matching probability (MP) result of 19test individuals》

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《基于毛干蛋白质组的族群推断技术的建立与验证》


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如前所述,检出率大于15%的nsSNP位点为88个,去掉连锁位点(R2>0.2)和三等位基因位点后共获得81个nsSNP位点.以千人基因组数据库中81个位点的分型数据为参考数据库,19个中国汉族人群为测试样本,计算随机人群匹配概率和似然比(以似然比大于100判断其最可能祖先来源),进行祖先来源的推断(表1).19个样本随机匹配概率最高的人群均为东亚,其中16个样本被正确预测为东亚人群,另外3个样本随机匹配概率最高的为东亚人群,与排第二的欧洲人群之间似然比小于100,因此不能判定这3个样本为东亚人群还是欧洲人群.通过STRUCTURE(K=3)计算19个测试样本的祖先成分,结果显示东亚祖先信息成分范围为99.2%~84.2%,表明所有测试样本均以东亚祖先成分为主(表2).