《表2 AdPOD27和AdPOD64的基本理化性质》
生物信息学分析表明,AdPOD27和AdPOD64的基本理化性质存在一定差异(表2),二者均为亲水性碱性蛋白,但AdPOD27属于稳定蛋白,而AdPOD64属于不稳定蛋白;AdPOD27中亮氨酸(Leu)含量最多,达到9.8%,其次是赖氨酸(Lys)和丙氨酸(Ala),分别为8.3%和8.0%,而AdPOD64中丝氨酸(Ser)含量最多,达到11.3%,其次是Leu和Ala,均为10.1%。亚细胞定位表明,AdPOD27和AdPOD64可能分别定位于线粒体和细胞外,二者分别于氨基酸序列5?端第1~26位和第1~24位氨基酸含有信号肽。保守结构域和结合位点预测表明,Ad POD27和Ad POD64蛋白均属于植物亚铁红素依赖Ⅲ型过氧化物酶超家族成员,主要参与细胞间隙和液泡的过氧化氢分解、生长素代谢、木质素合成和胁迫响应等(图2,3)。TMpred分析表明,Ad POD27含有4个由内向外和由外向内的跨膜螺旋结构以及28个磷酸化位点,Ad POD64含有4个由内向外和2个由外向内的跨膜螺旋结构,磷酸化位点个数为38。二级结构预测表明,Ad POD27中α-螺旋和β-折叠分别占45.9%和4.6%,而Ad POD64中二者含量分别为47.8%和2.5%。SWISS-MODEL预测表明,AdPOD27和AdPOD64与棕榈(Trachycarpus fortunei,PDB:4usc.1.A)的相似度分别达到45.12%和46.44%,以此为模型预测2个猕猴桃POD的三维结构(图4)。
图表编号 | XD0039840600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.01.01 |
作者 | 陈义挺、赖瑞联、冯新、高敏霞、程春振、陈文光、吴如健 |
绘制单位 | 福建省农业科学院果树研究所、福建省农业科学院果树研究所、福建省农业科学院果树研究所、福建省农业科学院果树研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建省农业科学院果树研究所、福建省农业科学院果树研究所 |
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