《表2 利用mi Randa, PITA和RNAhybrid预测Sli-miR-34-5p的潜在靶基因》
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《Sli-miR-34-5p响应植物次生物质正调控斜纹夜蛾谷胱甘肽S-转移酶基因SlGSTe1的表达》
为了探究Sli-miR-34-5p正调控SlGSTe1的具体机制,我们将SlGSTe1的ORF区域片段扩增后,构建到psi-check2载体,然后分别用Sli-miR-34-5p mimic和无义片段的mimic,影响载体上的报告基因酶活性。结果表明,Sli-miR-34-5p对SlGSTe1并没有调控作用,暗示两者并不直接结合(图6)。为探讨Sli-miR-34-5p是否间接调控SlGSTe1的表达,我们利用mi Randa,PITA和RNAhybrid 3个在线软件共同对Sli-miR-34-5p的靶基因进行预测,然后求其交集基因。结果如表2所示,预测的最为可能的靶基因包括了一系列功能基因:如表皮蛋白、丝氨酸蛋白酶及半乳糖基转移酶等。其中并没有SlGSTe1基因,表明在斜纹夜蛾进食芥菜过程中,Sli-miR-34-5p可能是通过某蛋白调控SlGSTe1的转录,而间接地正调控Sl GSTe1的表达。
图表编号 | XD0036513500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.01.20 |
作者 | 马康、邹晓鹏、岑永杰、郑思春 |
绘制单位 | 华南师范大学生命科学学院昆虫科学与技术研究所广州市昆虫发育调控与应用研究重点实验室、华南师范大学生命科学学院昆虫科学与技术研究所广州市昆虫发育调控与应用研究重点实验室、华南师范大学生命科学学院昆虫科学与技术研究所广州市昆虫发育调控与应用研究重点实验室、华南师范大学生命科学学院昆虫科学与技术研究所广州市昆虫发育调控与应用研究重点实验室 |
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