《表1 HBV新亚型与其他D亚型 (D1-D10) 全基因核苷酸序列的差异》

《表1 HBV新亚型与其他D亚型 (D1-D10) 全基因核苷酸序列的差异》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《广西那坡县发现乙肝病毒新基因亚型D11》


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注:表中数据表示各亚型间核苷酸序列差异的大小%(x±SD)。

共得到HBV全长基因序列30条,2011年标本经克隆、测序获得的15条序列命名为:NP137Q-1、NP137Q-2、NP137Q-3、NP137Q-4、NP137Q-5、NP137Q-6、NP137Q-7、NP137Q-8、NP137Q-9、NP137Q-11、NP137Q-12、NP137Q-14、NP137Q-15、NP137Q-17、NP137Q-20。2018年标本经克隆、测序获得的15条序列命名为:NP137-1、NP137-2、NP137-3、NP137-4、NP137-5、NP137-6、NP137-7、NP137-8、NP137-9、NP137-10、NP137-11、NP137-12、NP137-13、NP137-14、NP137-15。在NCBI GenBank检索到涵盖A—I的9个基因型共48条HBV全基因参考序列,采用邻位连接法对所获得的序列构建系统进化树。见图1。结果30个克隆株中有23个聚集在一起,Boostrap值为100%,提示这23条序列可能为新的亚型。基于全基因组核苷酸序列,计算其与D基因型其他亚型(D1-D10)的核酸差异,发现几乎都超过4%,因此将该新亚型命名为D11亚型。见表1。NP137Q-1、NP137Q-3、NP137Q-4与B2亚型所在的簇聚集在一起,Boostrap值为81%,提示这3个毒株为B2亚型。NP137Q-6、NP137Q-7、NP137Q-9、NP137Q-20与B基因型所在的簇聚集在一起,Boostrap值为99%,但这4个毒株位于B型簇的最外侧,提示其可能存在基因重组,为未知基因型毒株。2018年收集的标本所获得15个克隆株均为D11亚型,2011年收集的标本所获得15个克隆株有8个为D11亚型,3个为B2亚型,4个未能分型。