《表2 线粒体基因coxⅠ-rrnS引物和α-芋螺毒素前体基因引物》

《表2 线粒体基因coxⅠ-rrnS引物和α-芋螺毒素前体基因引物》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《海南产桶形芋螺线粒体基因组DNA提取条件的优化》


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通过NCBI数据库,对已知几种芋螺线粒体全长序列进行同源性比较,发现coxⅠ和rrnS基因区段具有高度的保守性,根据该区段设计PCR的引物(表2),克隆区段包含coxⅠ基因至rrnS基因,长度约4.5 kb。该区段内的基因可作为线粒体标志基因。以mtDNA为模板,扩增该目的片段采用长距离PCR(LA-PCR)反应体系:总体系25μL,Super HiFi Mix 12.5μL,ddH2O 11μL;PCR反应条件如下,预变性:94℃,2 min;循环内:变性94℃,30 s;退火50℃,30 s;延伸68℃,4 min,共30个循环,最后确保延伸72℃,10 min。取6μL PCR产物,跑琼脂糖凝胶电泳检测,胶浓度为1%,电压90 V,电泳时间25 min,观察条带,确定为目的基因后,将含有克隆片段的质粒送往上海生工测序,NCBI数据库比对。同时以桶形芋螺核基因组总DNA为模板,进行coxⅠ-rrnS基因的扩增,看所提核基因组DNA中是否含有mtDNA。