《表2 分离株YNZ20171109.01变异氨基酸位点》

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《犬细小病毒昆明流行株的分离鉴定与VP2基因序列分析》


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根据CPV基因分型国标(GB/T 34746—2017)判定分离毒株(命名为YNZ20171109.01)为CPV-2a型,BLAST比对后无100%同源,与标准毒株比对后存在5个变异氨基酸位点,分别是第5位甘氨酸转变为丙氨酸(G→A)、267位苯丙氨酸转变为酪氨酸(F→Y)、324位酪氨酸转变为异亮氨酸(Y→I)、440位苏氨酸转变为丙氨酸(T→A)及569位甲硫氨酸转变为异亮氨酸(M→I),属于变异毒株(表2)。将序列提交GenBank数据库,获得登录号为MG462710.1。将分离株与国内CPV序列和3株疫苗株比对,结果显示,该分离株与各参考株的同源性在98.2%~99.5%之间,与吉林延吉ANTU-1株(GenBank登录号:KP749837.1)、湖北武汉WH02/06株(GenBank登录号:EU377537.1)的同源性最高,与疫苗株同源性在98.6%~98.7%之间(图5)。系统进化树分析结果显示,分离株与吉林延吉ANTU-1株(GenBank登录号:KP749837.1)、吉林延吉DUNHUA-1(GenBank登录号:KP749839.1)、湖北武汉WH02/06株(GenBank登录号EU377537.1)及北京BJ01株(GenBank登录号:KR869652.1)亲缘关系最近,位于进化树的同一簇(图6)。