《表1 引物序列:液滴微流控单细胞转录组检测技术的建立和优化》
rG表示非脱氧乌甘酸;*表示硫代磷酸键.
利用R语言包Seurat[12]对单细胞数字表达谱进行筛选,标准如下:每个合格细胞内检测到基因的数量应≥200;每个合格的基因应在≥4个人源细胞或≥10个鼠源细胞内被检出;同时,每个细胞内线粒体基因表达量在全部基因表达总量中所占比例应≤10%。数据进一步标准化后进行主成分分析(PCA)[13],t-分布领域嵌入算法(t-SNE)[14]亚群聚类分析,差异基因分析和亚群特异性标志物鉴定。
图表编号 | XD0027981600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.01.30 |
作者 | 周鲁林、杨润坤、张文、冯林、肖汀、程书钧、张开泰、张蕾 |
绘制单位 | 国家癌症中心、国家肿瘤临床医学研究中心、中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院分子肿瘤学国家重点实验室癌发生及预防分子机理北京市重点实验室、哈尔滨医科大学附属第二医院结直肠肿瘤外科、国家癌症中心、国家肿瘤临床医学研究中心、中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院免疫学研究室、国家癌症中心、国家肿瘤临床医学研究中心、中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院分子肿瘤学国家重点实验室癌发生及预防分子机理北京市重点实验室、国家癌症中心、国家肿瘤临床医学研究中心、中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院分子肿瘤学国家重点实验室癌 |
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