《表3 Hd1-like基因编码区检测到的SNP位点》

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《谷子Hd1-like基因的克隆及其与农艺性状的关联分析》

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注:带阴影的位点位于外显子区，不带阴影的位点位于内含子区。

利用所设计的特异引物从11个谷子品种中均扩增出目标基因片段，大小与预期相符（图1）。扩增产物经克隆、测序，11个品种获得总长为2 351 bp的基因序列。对11条获得的Hd1-like基因序列进行多序列比对分析，在包含整个编码区、内含子区内共检测到43个突变位点，这些突变位点均为SNP，没有发现Indel。在编码区检测到24个SNP，内含子区检测到19个SNP（表3）。对检测到的SNP进行分析，发现核苷酸突变类型及它们的发生频率有所不同，主要为碱基A/G、T/C 2种替换类型（表3）。