《表1 引物信息:牛QPCT基因为母源等位基因表达的印记基因》
印记基因表现为单等位基因表达,为确定基因的表达状态,首先需要在基因的编码序列上寻找SNP位点用于区分等位基因。本研究采用对PCR产物直接测序的方法寻找SNP,如果测序峰图中存在双峰,即可确定存在SNP杂合位点。鉴定的杂合子用于等位基因表达分析。利用DNA提取试剂盒(生工生物工程公司上海),分别提取32头成年牛和15个胎盘样品的基因组DNA (genomic DNA,gDNA)。通过NCBI数据库得到牛QPCT基因的DNA序列(GenBank No.NC_037338.1),利用Oligo7.56软件在牛QPCT基因外显子序列上设计引物F1和R1 (表1),交由生工生物工程公司(上海)合成。经PCR直接测序寻找SNP位点。PCR反应体系:1μL DNA样品(100 ng/μL),12.5μL 2×Es Taq MasterMix (US Everbright Inc,美国),上下游引物(20μmol/L)各0.5μL,ddH2O 10.5μL。PCR反应条件:94℃5 min,30个扩增循环(94℃30 s,50℃30 s,72℃35 s),72℃终延伸7 min。用浓度为1.2%的琼脂糖凝胶对产物进行电泳检测,并将产物交由上海生工生物公司测序,通过Chromas 2.4.1软件分析测序峰图以鉴定SNP位点。
图表编号 | XD00224409100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.09.25 |
作者 | 谷书凯、刘晓倩、李俊良、陈玮娜、张萃、李冬杰、李世杰 |
绘制单位 | 河北农业大学生命科学学院、河北农业大学生命科学学院、河北农业大学生命科学学院、河北大学中医系、河北农业大学生命科学学院、河北科技大学生物科学与工程学院、河北农业大学生命科学学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |