《表2 南方地区100份水稻资源的SSR指纹图谱身份证》

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《中国南方地区水稻资源SSR指纹数据库的构建及遗传多样性分析》

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注:1～8:扩增得到条带分子量的大小顺序；@:扩增得到的杂合带型

构建水稻品种DNA指纹数据库比较常用的方法是引物组合法，即在满足能区分水稻材料的前提下，尽可能选择数量较少的引物构建指纹图谱身份证。通过对22对SSR引物的扩增条带进行统计分析，排除RM163、RM205、RM234、RM331、RM464、RM510、RM547、RM1111、RM2851、RM3585、RM4674、RM-5348等12对在扩增过程中出现缺失条带超过5%的引物及与其它引物间相似系数超过0.8的引物RM-5622，确定9对可用于100份水稻资源指纹图谱构建的候选引物，再根据ID Analysis软件的分析结果从这9对候选SSR引物中最终筛选出RM17、RM21、RM241、RM542、RM5608及RM6371等6对多态性较好能够区分南方地区100份水稻资源的引物，可用于水稻SSR指纹图谱的构建并得到属于每个水稻材料唯一的指纹图谱代码（表2）。