《表1 南方地区水稻资源的SSR引物遗传多样性参数》

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《中国南方地区水稻资源SSR指纹数据库的构建及遗传多样性分析》

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选用覆盖水稻12条染色体的22对SSR标记对100份不同来源水稻资源的多态性分析（表1），共得到161个等位基因（Na），平均每对引物为7.318 2个，不同引物扩增出的等位基因数存在较大差异，变幅为2 （RM5622）～14 （RM2851）个，其中RM2851 （14个）、RM163 （11个）、RM5348 （11个）和RM4674（10个）检测到的等位基因数均在10个以上；主要等位基因频率在0.180 0 （RM5248）～0.820 0 （RM205）之间，平均值为0.418 9；每对引物得到的基因型数目在3（RM5622）～29 （RM2851）之间，平均值为11.863 6；基因的多样性指数在0.303 0 （RM205）～0.872 6 （RM163）之间，平均值为0.705 3，基因的多样性较高；每对引物的多态信息含量（PIC）在0.269 8 （RM205）～0.859 6（RM163）之间，平均值为0.671 6，22对引物中除RM205、RM5622和RM1111为多态信息含量（PIC）在0.25～0.5之间的中度多态座位，其它所有引物的多态信息含量（PIC）均为>0.5的高度多态座位，以上参数表明本研究选取的22对引物具有较好的多态性，各个指标从不同角度反映了22对SSR引物的遗传多样性差异，说明本研究所选取的SSR引物能够很好的体现100份水稻材料的遗传多样性水平。