《表2 南方地区100份水稻资源的SSR指纹图谱身份证》
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《中国南方地区水稻资源SSR指纹数据库的构建及遗传多样性分析》
注:1~8:扩增得到条带分子量的大小顺序;@:扩增得到的杂合带型
构建水稻品种DNA指纹数据库比较常用的方法是引物组合法,即在满足能区分水稻材料的前提下,尽可能选择数量较少的引物构建指纹图谱身份证。通过对22对SSR引物的扩增条带进行统计分析,排除RM163、RM205、RM234、RM331、RM464、RM510、RM547、RM1111、RM2851、RM3585、RM4674、RM-5348等12对在扩增过程中出现缺失条带超过5%的引物及与其它引物间相似系数超过0.8的引物RM-5622,确定9对可用于100份水稻资源指纹图谱构建的候选引物,再根据ID Analysis软件的分析结果从这9对候选SSR引物中最终筛选出RM17、RM21、RM241、RM542、RM5608及RM6371等6对多态性较好能够区分南方地区100份水稻资源的引物,可用于水稻SSR指纹图谱的构建并得到属于每个水稻材料唯一的指纹图谱代码(表2)。
图表编号 | XD00220563800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.10.14 |
作者 | 陈越、陈玲、李春花、张敦宇、付坚、程在全 |
绘制单位 | 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南省农业生物技术重点实验室农业部西南作物基因资源与种质创制重点实验室、云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南省农业生物技术重点实验室农业部西南作物基因资源与种质创制重点实验室、云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南省农业生物技术重点实验室农业部西南作物基因资源与种质创制重点实验室、云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南省农业生物技术重点实验室农业部西南作物基因资源与种质创制重点实验室、云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南省农业生物技术重点 |
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