《表1 核酸序列同源性对比》

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《2018年青海省手足口病病原谱的构成及基因特征分析》

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对细胞培养分离得到的306株细胞培养物，测序选取典型的15株非EV-A71、CVA16型柯萨奇病毒A、B组基因序列进行核酸序列分析，15株核酸序列间同源性存在很大差异，全部序列间核苷酸性分别在23.5%～100%之间，5株CVA6型（06、51、78、87、107）核酸序列之间的同源性在95.5%～99.9%之间，CVA4型（6、26、67、）三株核酸序列之间的同源性在96.3%～99.9%之间，CVA2（02、89）两株核酸序列的同源性为92.0%，CVB1(02、85）CVB5(50、54）的核酸同源性为23.5%～91.2%，CVA10(76）和其他的基因型间核酸序列的同源性较低，在48.6%～61.5%之间；不同基因型间核酸序列差异性较大，在24.9%～100%之间（表1），表明青海省HFMD病毒流行株柯萨奇病毒A、B组核酸序列不同基因型之间的变异性强。