《表2 荆芥St DXS基因中RSCU>1密码子》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《荆芥1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合成酶基因克隆及生物信息学分析》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

利用Codon W和EMBOSS软件分析荆芥St DXS基因的密码子适应指数（codon adaptation index，CAI）、有效密码子数（effective number of codons，ENC）、不同位置的GC含量（GC1s、GC2s、GC3s）、总GC含量、同义密码子相对使用度（relative synonymous codon usage，RSCU）。结果表明CAI为0.3176、ENC为55.083，说明密码子偏性较弱；总GC值为0.474 7<0.5，GC1s、GC2s和GC3s分别为0.568 8、0.445 1和0.4103，说明该基因编码区的A/T含量高于G/C含量；当RSCU=1时，密码子没有偏好性；当RSCU>1时，密码子具有偏好性，表2中RSCU>1的密码子共有28个，其中19个以A/T结尾，9个以G/C结尾，说明荆芥St DXS基因偏好于使用A或T结尾的密码子。