《表4 DREB2A各组等位基因RSCU平均值》
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《不同水稻种质中渗透胁迫抗性基因DREB2A的遗传多样性分析》
DREB2A是一个重要的抗逆基因,参与水稻抵御干旱、盐害和冷害等逆境胁迫的生理功能[26],因此在不同类型水稻种质中发掘其同源基因和功能性变异具有重要意义。目前,前人研究从稻属基因组中的DREB2A基因区域鉴定获得了34个单核苷酸多态性(SNP)位点和69个插入缺失(In Del)位点,其中4个SNP位于编码区,其他变异则均位于非编码区[25,27]。本研究对非洲栽培稻(Oryza glaberrima)和普通栽培稻(Oryza sativa)种质中的DREB2A基因核苷酸变异位点进行了发掘,共检测到55个变异位点,包含42个SNP位点,6个片段替换位点(2~3 bp),3个长度多态性位点(0~9 bp),4个In Del位点。其中1个片段替换位点位于第一外显子区,11个SNP位点和1个In Del位点位于第二外显子区;其他43个变异位点则均位于内含子区,包括31个SNP位点,5个片段替换位点,3个长度多态性位点和3个In Del位点。这些结果表明,相对于非编码区来说,DREB2A的编码区(CDS区)更加保守。尽管本研究获得的核苷酸变异数量与前人研究近似,但检测到了更多的SNP和功能性变异位点,如在编码区鉴定获得了12个非同义突变位点,均导致了相应氨基酸编码序列的改变,表明这些变异对DREB2A基因的功能具有直接影响。
图表编号 | XD00202348900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.12.15 |
作者 | 谭景发、贺文闯、董西龙、党腾飞、谢怿、席锟、孙勇胜、胡亚林、靳德明 |
绘制单位 | 华中农业大学植物科学技术学院农业部长江中游作物生理生态与耕作重点实验室、华中农业大学植物科学技术学院农业部长江中游作物生理生态与耕作重点实验室、华中农业大学植物科学技术学院农业部长江中游作物生理生态与耕作重点实验室、华中农业大学植物科学技术学院农业部长江中游作物生理生态与耕作重点实验室、华中农业大学植物科学技术学院农业部长江中游作物生理生态与耕作重点实验室、华中农业大学植物科学技术学院农业部长江中游作物生理生态与耕作重点实验室、华中农业大学植物科学技术学院农业部长江中游作物生理生态与耕作重点实验室、华中农 |
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