《表2 人埃博拉病毒的同义密码子使用度(RSCU)》
注:AA.氨基酸;GP.糖蛋白;NP.核蛋白;L.L聚合酶蛋白;VP.病毒蛋白。RSCU值大于或等于1者用黑色加粗字体显示,代表相对使用较多的密码子。
本研究通过计算了人埃博拉病毒各蛋白的RSCU值(表2),分析结果显示7种蛋白(GP、L、NP、VP24、VP30、VP35、VP40)中RSCU>1的密码子数分别有30、32、31、32、32、32、32个,其中77%以上是以A/U结尾,只有少部分是以C/G结尾,说明人埃博拉病毒相对使用较多的密码子偏爱于以A/U结尾,且不同的蛋白密码子偏爱性的不同。此外,7种蛋白中筛选出18个共有偏爱密码子,它们分别为UUU、UUG、CUU、AUG、AUU、UCU、CCU、UAU、CAU、AAU、GAA、UGG、AGU、AGA、AGG、GGA。
图表编号 | XD00129506900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.03.01 |
作者 | 魏雪玲、田明明、刘奇 |
绘制单位 | 云南省昆虫生物医药研发重点实验室(大理大学)、大理大学基础医学院病原生物学综合实验室、云南省昆虫生物医药研发重点实验室(大理大学)、大理大学基础医学院病原生物学综合实验室、云南省昆虫生物医药研发重点实验室(大理大学)、大理大学基础医学院病原生物学综合实验室 |
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