《表1 药物综合信息及其协同性相关的常用数据库》

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《从药物信息学角度研究药物协同性的研究进展》

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基于药物信息学技术进行药物的协同性研究需要高质量数据的支持，充分利用已有的各类信息资源是重要的前提，一些常用的数据库见表1，如DCDB[5]、ASDCD[6]以及一些其他相关联的数据库[5-17]，如Drug Bank[7]、CHEMBL[8]、TTD[9]、STRING[10]、KEGG[11]、Gene Ontology[12]等。其中，DCDB是收集和组织药物组合的数据库，该数据库根据>14万例的临床数据与FDA批准的橙皮书制定了包括1 363种药物组成的866种药物组合。ASDCD是抗真菌协同药物组合数据库，该数据库包括210种抗真菌增效药物组合和1 225种药物-靶标相互作用数据。Drug Bank是一个关于药物、机制、相互作用和目标的全面的分子信息数据库，包括2 358个FDA批准的药物。CHEMBL为几乎所有可用的小化合物提供化学信息，包括大量药物类生物活性化合物的绑定、功能和附件信息。TTD是一个专门用于注释已知和探索的大分子药物靶点的数据库，包括已批准药物、临床试验和实验药物的蛋白、核酸、靶标、疾病蛋白信息、通路的治疗靶标。KEGG为药物提供代谢信息，为药物靶点提供蛋白质注释，包括系统信息、基因组信息、化学信息和卫生信息。Gene Ontology（GO）是基因本体数据库，包括分子功能、细胞组件和生物过程3个方面，常用的软件有DAVID[18]、Cytoscape[19]、Metascape[20]等。