《表2 易感基因及差异SNP位点信息》
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《一级亲属伴有代谢异常疾病的PCOS患者易感基因研究》
DAVID在线软件对差异SNP位点注释到的1195个基因进行KEGG pathway富集分析,结果总富集到23个信号通路,富集到的基因数(Count)前10的(P≤0.05)信号通路分别是癌症信号通路(Pathways in cancer),神经活性配体-受体交互作用信号通路(Neuroactive ligand-receptor interaction),c AMP信号通路,钙离子信号通路,Rap1信号通路等(图1)。用string在线软件对Rap1信号通路中的19个基因进行PPI分析,筛选出来8个关键节点基因(至少与4个蛋白有相互作用),分别是INSR、GNAO1、PIK3CD、FGF13,KDR、VEGFC、PL-CB4、ANGPT1等(图2)。对这8个基因上的差异SNP位点进行筛选,最后确定的易感基因GNAO1、PIK3CD、FGF13。易感基因GNAO1上的SNP位点rs2587885;PIK3CD上的SNP位点rs6541017,FGF13上的SNP位点rs527687、rs683357和rs7060413,见表2。
图表编号 | XD00210971700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2021.01.31 |
作者 | 林琳、李明明、肖兵、穆巴热科·阿迪力、肖金宝 |
绘制单位 | 新疆医科大学第一附属医院妇科、新疆乌鲁木齐市经济技术开发区(头屯河区)第一人民医院妇产科、新疆医科大学第一附属医院妇科、新疆医科大学第一附属医院妇科、新疆医科大学第一附属医院妇科 |
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