《表1 46株绿针假单胞菌基因组信息》

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《绿针假单胞菌泛基因组分析及次级代谢通路挖掘》


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将表1中菌株对应的fasta格式基因组数据上传至REALPHY(http://realphy.unibas.ch/realphy)进行全基因组比对[15],以Pseudomonas chlororaphis subsp.chlororaphis DSM_50083为参考基因组,采用最大似然(ML)算法,使用默认参数运行。运行结果使用Fig Tree v1.4.4软件(http://tree.bio.ed.ac.uk/software/figtree/)重构进化树。