《表1 鞍子河保护地经DNA鉴定筛选出的有效水鹿粪便样品》
在实验室对野外采集的50份样品按以下步骤进行物种鉴定:动物基因组DNA提取–PCR扩增–PCR产物回收–序列测定与分析–物种鉴定。在PCR扩增中,以稀释后的基因组DNA为模板,采用线粒体细胞色素C氧化酶亚基COI基因序列为识别条形码,以L16457和H16781为特异引物(L16457:5'-TGT ACC TCT TCT CGC TCC GGG-3';H16781:5'-TTA TTG TCC TGT GAC CAT TGA CTG A-3'),并用高效保真酶进行PCR扩增,然后对样品纯化后的PCR产物使用测序仪ABI3730-XL进行DNA测序,并在NCBI (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)公共数据库中进行动物物种比对,选择相似度最大的序列作为物种鉴定结果,本研究以99%作为物种相似度的阈值。通过鉴定,本研究共获得水鹿有效粪便样品18份(表1),Mata等(2019)研究认为12个独立粪便样品能记录95%的摄食物种信息,故本研究的样品数筛选结果能满足水鹿冬季食性研究的要求。
图表编号 | XD00208032100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.10.01 |
作者 | 张全建、杨彪、付强、王磊、龚旭、张远彬 |
绘制单位 | 中国科学院水利部成都山地灾害与环境研究所、中国科学院大学、西华师范大学西南野生动植物资源保护教育部重点实验室、四川鞍子河省级自然保护区管理处、四川鞍子河省级自然保护区管理处、中国科学院水利部成都山地灾害与环境研究所、中国科学院大学、中国科学院水利部成都山地灾害与环境研究所 |
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