《表1 鞍子河保护地经DNA鉴定筛选出的有效水鹿粪便样品》

《表1 鞍子河保护地经DNA鉴定筛选出的有效水鹿粪便样品》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《邛崃山系水鹿的冬季食性》


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在实验室对野外采集的50份样品按以下步骤进行物种鉴定:动物基因组DNA提取–PCR扩增–PCR产物回收–序列测定与分析–物种鉴定。在PCR扩增中,以稀释后的基因组DNA为模板,采用线粒体细胞色素C氧化酶亚基COI基因序列为识别条形码,以L16457和H16781为特异引物(L16457:5'-TGT ACC TCT TCT CGC TCC GGG-3';H16781:5'-TTA TTG TCC TGT GAC CAT TGA CTG A-3'),并用高效保真酶进行PCR扩增,然后对样品纯化后的PCR产物使用测序仪ABI3730-XL进行DNA测序,并在NCBI (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)公共数据库中进行动物物种比对,选择相似度最大的序列作为物种鉴定结果,本研究以99%作为物种相似度的阈值。通过鉴定,本研究共获得水鹿有效粪便样品18份(表1),Mata等(2019)研究认为12个独立粪便样品能记录95%的摄食物种信息,故本研究的样品数筛选结果能满足水鹿冬季食性研究的要求。