《表4 抗逆相关基因详细情况》

《表4 抗逆相关基因详细情况》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《镉胁迫后旱柳转录组变化分析》


  1. 获取 高清版本忘记账户?点击这里登录
  1. 下载图表忘记账户?点击这里登录

根据表3可知,相同时间不同浓度的差异表达基因(Differentially expressed genes,DEG)分析表明:第1天组(L1-CK1和H1-CK1)中的差异基因数为8 550个(3 660个上调和4 890个下调);第7天组(L7-H7)的差异基因数为3 444个(1 307个上调和2 137个下调);第30天组(L30-CK30和H30-CK30)中的差异基因数为11 428个(5 055个上调和6 373个下调)。相同浓度不同时间的DEG分析表明:2.5 mg/L组(L1-CK0、L7-L1、L30-L7)中的差异基因数为26 623个(14 531个上调和12 092个下调;50 mg/L组(H1-CK0、H7-H1、H30-H7)中的总差异基因数为32 154个(18 318个上调和13 836个下调),这表明50 mg/L浓度的镉胁迫比2.5 mg/L的对旱柳的影响更加明显,这些差异表达基因可能在胁迫过程中起关键作用。此外,在L1-CK1、H1-CK1、L30-CK30和H30-CK30这4组中有共同的170个DEG(其中46个共同上调和29个共同下调),它们的基因表达量差异达2倍(|Log2ration|≥1)以上。170个DEG中又有25个其表达量差异是大于1 000倍(|Log2ration|≥10)以上的,其中19个是上调,6个下调(表4)。金属硫蛋白基因、ABC转运家族、锌和锰转运蛋白家族的基因表达会随着Cd浓度的增高和胁迫时间的增加而有较大的变化,L7-L1、L30-L7、H7-H1、H30-H7组中金属硫蛋白共9个上调、11个下调;ABC转运家族共90个上调、88个下调,其中H30-H7中32个上调、50个下调;锌和锰转运蛋白家族有28个下调、8个上调,这些结果表明旱柳在应对Cd胁迫的过程中金属硫蛋白基因、ABC转运家族及锌和锰转运蛋白起了很大的作用,也说明Cd胁迫会影响旱柳对其他金属离子的吸收,锌和锰转运蛋白表达量的变化可能是因为Cd在生命体内会置换锌,导致生命体需锌的蛋白质发生“饥饿”,为了生命正常活动的进行,旱柳加快了锌的转运过程,从而使锌、锰蛋白转运蛋白家族的表达发生变化。