《表3 基于菌种水平的Alpha多样性》

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《宏基因组学探究原料乳冷藏过程菌群变化规律》

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原料乳4℃冷藏样本物种分布Venn图（图2）显示：属水平上共注释到589个菌属，种水平上共注释到1 668个菌种。表3为基于种水平的Alpha多样性分析结果，冷藏期间Chao1指数与ace指数呈上升趋势，说明物种随冷藏时间的增加而增加；Shannon指数与Simpson指数综合菌群组成丰富度与均匀度反映了样本的多样性，数据显示样本多样性A0大于A3大于A1，这可能因为原料乳冷藏24 h后不耐冷微生物的丰富度大幅降低，冷藏72 h后嗜冷微生物的大量繁殖使物种多样性增加。另外，各样本基于种水平的PCo A分析结果显示（图3），组内样本点较聚集，差异较小，各样本组间区分较明显，组间差异较大。说明分组有意义，物种在原料乳冷藏期间有显著变化。