《表1 南瓜中32个ARF基因的理化特性》
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《南瓜生长素响应因子(ARF)基因家族的全基因组分析及表达分析》
基因标识号来源于CuGenDB (http://cucurbitgenomics.org/)。
以At ARF蛋白序列作为查询序列,通过与CuGen DB进行比对初步获得Cm ARF序列。去除一些冗余序列后,共鉴定出32个Cm ARF基因(表1)。根据32个基因在染色体上的起始位置,分别命名为Cm ARF1~Cm ARF32 (从Cmo_Chr00到Cmo_Chr20,从上到下)。32个Cm ARF基因的开放阅读框长度范围从1 578 bp (Cm ARF13)至3 537 bp (Cm ARF24),编码的32个Cm ARF蛋白序列长度在525~1 178个氨基酸之间,分子质量范围为57.6~131.5 k Da。除Cm ARF29 (7.09)、Cm ARF17 (8.31)、Cm ARF22(8.39)、Cm ARF3 (9.28)和Cm ARF32 (8.79)等电点较高以外,大多数Cm ARF蛋白等电点都较低(<7)。亚细胞定位预测表明所有Cm ARF蛋白都在细胞核中表达。
图表编号 | XD00203030800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.11.20 |
作者 | 袁敬平、申长卫、陈碧华、李新峥 |
绘制单位 | 河南科技学院园艺园林学院、河南省园艺植物资源利用与种质创新工程研究中心、河南省园艺植物资源利用与种质创新工程研究中心、河南科技学院资源与环境学院、河南科技学院园艺园林学院、河南省园艺植物资源利用与种质创新工程研究中心、河南科技学院园艺园林学院、河南省园艺植物资源利用与种质创新工程研究中心 |
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