《表1 在正常胃组织中rs760077基因型与周围基因表达水平关联》
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《染色体1q22区域遗传变异影响胃癌易感性的生物学机制研究》
本研究通过GTEx数据库中324例正常胃组织的基因型和基因表达数据,对rs760077及其上下游1Mb范围内的所有基因进行e QTL分析。如表1所示,在72个基因中,THBS3、GBAP1、GBA、FAM189B、RP11-263K19.4、RUSC1-AS1、RP11-263K19.6、SYT11和MTX1等基因的表达水平与rs760077基因型存在显著关联(P<0.05),而仅与THBS3、GBAP1、GBA基因的关联达到Bonferroni多重校正的标准(0.05/72,P<6.94×10-4),其中rs760077的A等位基因在显著降低THBS3表达的同时(P=1.20×10-21,图1A),也能够显著增加GBA(P=1.80×10-4,图1B)和GBAP1(P=3.49×10-17,图1C)的表达水平,提示THBS3、GBA、GBAP1可能是1q22区域的候选易感基因。
图表编号 | XD00201789500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.11.15 |
作者 | 颜财旺、高志颖、黄童童、靳光付 |
绘制单位 | 南京医科大学公共卫生学院流行病学系、南京医科大学公共卫生学院流行病学系、南京医科大学公共卫生学院流行病学系 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |