《表2 基因在对侧正常乳腺组织、癌旁组织和肿瘤组织中的表达模式》

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《乳腺癌癌旁组织特异性表达基因分析》

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模式:两个字母分别表示从CBN到NAT，NAT到T的变化趋势，其中U:上调（up-regulated）；D:下调（down-regulated）；S:稳定（stable）；MGC:平均基因数（mean gene count）；RGC；在55%以上患者复现的基因数目（recurrent gene count）；MS:富集分数的平均值（mean score），MS=Σ[-log1

对CBN、NAT与T进行差异表达分析，根据基因从CBN到NAT再到T的表达水平变化，可将基因的表达模式划分成4种类型，即NAT特异性表达型（NAT-specific，A型），梯度型（gradient，G类），类肿瘤型（tumour-like，T型）和类正常型（normal-like，N型）[5]。同时用“1”和“2”分别表示基因上调和下调，可以将基因的表达模式细分为8个小类。对每个病人的DEG划分类型后统计每种类型的平均基因数目和高频复现基因数目（定义为55%以上患者共有的基因），并分别做了富集分析，计算了平均富集分数（表2）。