《表1 nir S和nir K型反硝化细菌的OTU丰度和α多样性》
由表1可知,所测得的nir S基因和nir K基因序列可分别被划分为22个和68个OTU,说明nir K型反硝化细菌的种类明显比nir S型反硝化细菌的种类丰富。nir K型反硝化细菌的Chao指数、Ace指数、Shannon指数均高于nir S型反硝化细菌,进一步说明nir K型反硝化细菌的种类丰富度高于nir S型反硝化细菌。nir K型反硝化细菌的Simpson指数低于nir S型反硝化细菌,说明nir K型反硝化细菌的种类丰富度虽高于nir S型反硝化细菌,但均匀度却低于nir S型反硝化细菌。nir S基因和nir K基因文库的覆盖度都为100%,说明测序已获得nir S基因和nir K基因文库中100%的序列,测序数量足够。nir S和nir K基因型反硝化细菌OTU丰度稀释度曲线显示(图3和图4),在测序数量增加的过程中,测序数量<10 000时,曲线均已趋于平行,则表明随着测序数量的增加,OTU数不再增加,通常认为此时测序数据量合理。
图表编号 | XD00201160400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2021.02.25 |
作者 | 陈泽斌、李冰、林丽、刘佳妮、余磊、徐胜光 |
绘制单位 | 昆明学院农学与生命科学学院、中国科学院昆明动物研究所、昆明学院农学与生命科学学院、昆明学院农学与生命科学学院、云南省都市特色农业工程技术研究中心、云南省高校生物炭工程研究中心 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |