《表1 nir S和nir K型反硝化细菌的OTU丰度和α多样性》

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《nirS和nirK型反硝化细菌在水稻根中的分布》


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由表1可知,所测得的nir S基因和nir K基因序列可分别被划分为22个和68个OTU,说明nir K型反硝化细菌的种类明显比nir S型反硝化细菌的种类丰富。nir K型反硝化细菌的Chao指数、Ace指数、Shannon指数均高于nir S型反硝化细菌,进一步说明nir K型反硝化细菌的种类丰富度高于nir S型反硝化细菌。nir K型反硝化细菌的Simpson指数低于nir S型反硝化细菌,说明nir K型反硝化细菌的种类丰富度虽高于nir S型反硝化细菌,但均匀度却低于nir S型反硝化细菌。nir S基因和nir K基因文库的覆盖度都为100%,说明测序已获得nir S基因和nir K基因文库中100%的序列,测序数量足够。nir S和nir K基因型反硝化细菌OTU丰度稀释度曲线显示(图3和图4),在测序数量增加的过程中,测序数量<10 000时,曲线均已趋于平行,则表明随着测序数量的增加,OTU数不再增加,通常认为此时测序数据量合理。