《表1 nir K和nir S基因引物1)》

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《磷差异性调控水稻根际nirK/nirS型反硝化菌组成与丰度》


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1) 上下游引物分别标注为F和R;引物序列Y=C或T,R=A或G,S=C或G,V=A,C或G,D=A,G或T,B=C,G或T,N=A,C,T或G

利用带有8个碱基序列barcode的nirK-F1aCu/R3Cu和nir S-cd3aF/R3cd分别对nir K和nirS基因进行扩增(表1),所用仪器为Eppendorf Mastercycler(Model-5333).PCR反应体系为50μL,包括上下游引物(10μmol·L-1)各2μL,2×PCR mix(Hot Start PCR Enzyme,Takara)25μL,DNA模板2μL(20 ng·μL-1),ddH2O补至50μL.nir K基因扩增程序为:98℃预变性2 min,30个循环(98℃,10 s;58℃,30 s;72℃,45 s),最后72℃延伸10 min.nirS基因扩增程序为:98℃预变性2min,30个循环(98℃,10 s;54℃,30 s;72℃,45s),最后72℃延伸10 min.