《表1 竹叶兰根共生真菌OTU丰度和ɑ多样性指数》

《表1 竹叶兰根共生真菌OTU丰度和ɑ多样性指数》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《竹叶兰根系共生真菌群落结构及生物学功能初探》


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注:Rs,根围土壤;Rp,根表;Ep,根内(下同)

对3丛野生竹叶兰根围土壤、根表和根内3个生态位共9个样品的真菌rDNA基因ITS1区域进行高通量测序,质控后,每个样品的测序clean reads数据量均超过80 000条(表1),clean reads有效率超过90%。以测序数据量对应OTU数量构建的稀释曲线显示,当测序clean reads达到60 000条,样品中OTU数量基本处于平台期(图1),说明测序数据量能够覆盖样品中绝大多数真菌种类,测序数据量合理。每个样品的Good’s coverage指数均达到0.999(表1),说明样本中有序列没有被测出的概率极低,测序深度合格。