《表2 基于97%相似性水平下的OTU的多样性、丰富度和16S r RNA基因绝对丰度》

《表2 基于97%相似性水平下的OTU的多样性、丰富度和16S r RNA基因绝对丰度》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《南极菲尔德斯半岛潮间带沉积物细菌群落结构分析及产酶菌株初步筛选》


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19个站位样品高通量测序共获得697 260条序列,平均序列长度为273 bp,样品原始序列数在31 197~44 799之间,抽平后序列数为27 791。97%相似水平下共获得2 375个OTU,菲尔德斯半岛东部样品的OTU数目(Mn=954)、Shannon指数(Mn=4.83)和Chao1指数(Mn=1205)普遍高于西部样品(Mn分别为610、3.92、823)(独立样品t检验,P<0.05)(表2)。每个站位的覆盖度数值(Good’s Coverage)都在98%以上,表示本研究的采样可以较好地代表采样区域的微生物群落组成。荧光定量PCR结果显示,西部区域的细菌丰度平均为3.49×108 copies·g–1,W1站位细菌丰度最高,W4站位细菌丰度最低,东部区域的细菌丰度平均为1.89×108 copies·g–1,E11站位细菌丰度最高,在E2、E3和E9站位细菌丰度较低。