《表2 SAR86基因组信息一览表[10]》

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《海洋细菌SAR86研究进展》


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基因组是指一个生物体中所有携带遗传信息的遗传物质总和,开展海洋微生物基因组学研究不仅有助于了解海洋微生物生理生化、多样性特征及其在海洋生态系统中的地位,而且对微生物功能基因鉴定和生物进化有着积极的促进作用。由于SAR86至今还无法进行纯培养,所以Dupont等[10]利用宏基因组学技术进行测序和拼接,装配了两个几乎完整的基因组SAR86A和B,其中SAR86A基因组由41个重叠群组成,序列总长为1.25Mbp;SAR86B基因组由31个拼接片段组成,序列总长为1.70Mbp;两个基因组分别含有1 316和1 712个开放阅读框。鉴于宏基因组组装可能产生的偏差,Dupont等还采取了单细胞测序方法对两个鉴定为SAR86的单细胞重新扩增测序,得到了SAR86C和D,总长度分别为750和925Kbp,分别位于142和194个重叠群之间,具体基因组信息如表2所示。