《表5 枢纽基因基本信息(n=10)》
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《GWGS芯片整合分析识别外周血细胞中与骨质疏松症相关的枢纽基因》
对GWGS值排序前200的DEGs进行GO富集分析和KEGG通路分析。GO分析结果显示,富集最显著的前3个条目分别为脂多糖的细胞反应(cellular response to lipopolysaccharide,GO:0071-222,P=3.30E-05)、凋亡过程(apoptotic process,GO0006915,P=1.60E-04)和炎症反应(inflammatory response,GO:0006954,P=2.69E-04)。表3展示了排序前10的GO富集条目的具体信息。KEGG通路分析显示,筛选出的基因富集于骨质疏松症相关信号通路。其中,最显著的通路为破骨细胞分化通路(osteoclast differentiation,hsa04380,P=2.54E-03)。表4展示了排序前10的KEGG富集通路条目的具体信息。由200个DEGs构建的PPI网络结果如图1所示,该网络由196个节点和511条边组成。图中深色的节点代表枢纽基因,节点越大,代表连接度越大。结果显示其中10个基因的连接度大于20,提示为与骨质疏松症相关的枢纽基因(表5)。枢纽基因中具有最大度值的基因是位于14号染色体上的AKT1基因(度=44)。
图表编号 | XD00170760200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.04.30 |
作者 | 黎海霞、许阳、邓凯丽、李然、肖苏妹 |
绘制单位 | 中山大学公共卫生学院、中山大学公共卫生学院、中山大学公共卫生学院、中山大学公共卫生学院、中山大学公共卫生学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |