《表3 Fab H/B/F抑制剂一览表》

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《Ⅱ型脂肪酸生物合成途径机制和药物发现研究进展》

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目前来自于13类菌属的Fab D结构已被解析，其三级结构和重要功能氨基酸高度保守（附表3(附件）)[21-22].以Ec Fab D晶体结构为例，Ec Fab D由大小两个结构域组成.其大结构域（氨基酸1～126和199～309）属于磷脂酶A2结构域超家族，其核心为反平行的β折叠，包含了主要参与催化的GHSVG保守五肽区域.β折叠被12个α螺旋包围，其中5个α螺旋在蛋白质表面形成螺旋瓣.小结构域（氨基酸127～198）为铁氧化还原蛋白样（Ferredoxin-like）折叠，由一个四链的反平行β折叠和两个α螺旋组成（图4b）[23-24].其中，来自大结构域的Q11、Q63和R117通过侧链的氢键和盐桥作用稳定伸入通道的Co A上的丙二酰基，催化二联体His91-Ser92的丝氨酸则与丙二酰基部分共价连接，而M121及其相邻氨基酸与Fab D严格的底物特异性有关（图4b）[22].而来自小结构域的P164、Q166、R190和大结构域的R287在通道入口处共同锚定了丙二酰Co A的核糖部分.