《表1 SCo T差异片段序列分析》

《表1 SCo T差异片段序列分析》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《高温胁迫下杜鹃差异表达基因的cDNA-SCoT分析》


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注:JCK,JH:‘江南春早’对照组和高温组;YCK,YH:‘胭脂蜜’对照组和高温组

使用NCBI的BLAST程序对着16条序列做同源性对比分析,同源序列基因的功能由E值确定,16条序列中有13条可以预测其功能,未知功能的序列有3条(表1)。按照植物基因功能分类标准(Bevan et al.,1998),与已知功能的基因进行对比,结果表明,目的片段的功能有防御反应、细胞结构、代谢及转录等(图4;表1)。‘胭脂蜜’中涉及防御机制的EST基因3个,其中SCo T5 (腺苷5'-磷酰硫酸激酶还原酶琢-亚基)和SCo T32 (基辅酶M还原酶)特异表达,而SCo T31 (砷酸还原酶)上调表达;涉及转录的EST有1个,SCo T40 (MYB8)特异表达;涉及能量代谢的EST有1个,SCo T39 (锌金属蛋白酶)特异表达;涉及细胞结构的EST基因有3个,其中SCo T12 (DNA旋转酶亚基)和SCo T22 (网状细胞结合蛋白)及SCo T28(假设的二硫化物异构酶)均特异表达。‘江南春早’中涉及防御机制的EST基因有2个,编号分别为SCo T28 (谷胱甘肽转移酶,GSTs)和SCo T39 (过氧化氢酶,CAT)均特异表达;涉及代谢的EST基因有1个,SCo T8 (鲨烯环氧酶)下调;涉及细胞结构的EST有2个SCo T6 (氨基酸同源框蛋白)和SCo T40 (锌指CCCH域包含蛋白)均下调表达。未知功能的EST有3个,编号分别为SCo T14、SCo T23、SCo T8 (图4)。