《表3 SCo T引物序列》

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《九个中华类红肉猕猴桃品种的亲缘关系及其溃疡病抗性分析》


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提取所有猕猴桃品种的基因组DNA,稀释到50 ng/滋L,使用SCo T引物进行PCR扩增,使用的SCo T引物根据Collard和Mackill(2009)公布的36条引物序列和Luo等(2011)公布的40条引物序列进行合成。在Bio-Rad S1000 PCR仪上对所有引物进行筛选,最终筛选出扩增产物条带清晰、多态性好的10条SCo T引物(表3),用于所有DNA样品的扩增。SCo T引物扩增的20滋L反应体系包括2伊Taq PCR Mix 10滋L,DNA (50 ng/滋L)1.0滋L,10滋mol/L引物0.6滋L,超纯水8.4滋L。反应程序:94℃预变性5 min;94℃变性1 min,50℃退火1 min,72℃延伸2 min,循环35次;72℃延伸8 min。扩增完成后取8滋L扩增产物,使用2%的琼脂糖电泳分离,在凝胶成像仪上观察并拍照保存。人工统计SCo T扩增引物在琼脂糖凝胶上同一位置是否出现条带,有记为1,没有记为0。统计数据输入Excel表格,建立扩增谱带0/1矩阵数据库,使用SPSS 19.0软件进行系统聚类分析。