《表3 芽孢杆菌脂肽类抗生素引物》
通过对各引物PCR程序优化(表3),得到最佳PCR反应程式为94℃预变性3 min,95℃变性45 s,60℃(ItuA为65℃)退火45 s,72℃延伸1min,30个循环,最后72℃再延伸5 min。采用该程序对CLPs相关合成基因序列进行扩增,发现所设计的引物中有12对可有效扩增芽孢杆菌CLPs基因(BamD-F/R,BamA-F/R,FenA-F/R,FenB-F/R,61FenA-F/R,61F-enB-F/R,ItuA-F/R,ItuB-F/R,ItuC-F/R,ItuD-F/R,Srf AA-F/R,SrfAB-F/R),供试芽孢杆菌中具有拮抗能力的芽孢杆菌均能扩增到ItuC基因。20株芽孢杆菌中,能扩增到BamD的达80%,能扩增到BamA的达90%,能扩增到FenA的达80%,能扩增到Fen B的达90%,能扩增到61FenA的达25%,能扩增到61FenB的达45%,能扩增到ItuA的达45%,能扩增到Itu B的达95%,能扩增到ItuC的达100%,能扩增到ItuD的达65%,能扩增到SrfAA的达65%,能扩增到Srf AB的达85%,MycF与Myc A均不能扩增到目的条带,其中ItuC的覆盖率最高,BamD、BamA、FenB、ItuA的特异性最高(图3)。
图表编号 | XD00194391700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.12.28 |
作者 | 邓涛、郭立佳、杨腊英、周游、汪军、柳志强、黄俊生 |
绘制单位 | 海南大学生命科学与药学院、中国热带农业科学院环境与植物保护研究所农业农村部热带作物有害生物综合治理重点实验室、中国热带农业科学院环境与植物保护研究所农业农村部热带作物有害生物综合治理重点实验室、中国热带农业科学院环境与植物保护研究所农业农村部热带作物有害生物综合治理重点实验室、中国热带农业科学院环境与植物保护研究所农业农村部热带作物有害生物综合治理重点实验室、中国热带农业科学院环境与植物保护研究所农业农村部热带作物有害生物综合治理重点实验室、海南大学生命科学与药学院、中国热带农业科学院环境与植物保护研究所 |
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