《表1 NOD-like and Toll-like receptor signaling pathway各化学成分与靶点蛋白作用的Total Score值》

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鉴于NOD-like receptor signaling pathway、Tolllike receptor signaling pathway的Benjamini correction较小,为5.8E-5、1.5E-6。为此,以NOD-like receptorsignaling pathway、Toll-like receptor signaling pathway涉及的靶点蛋白MAPK1(PDB ID:6SLG)、IL6(PDBID:1ALU)、HSP90AA1(PDB ID:3O0I)、TNF(PDB ID:6M95)、CCL2(PDB ID:5J5Y)、NFKB1(PDB ID:1LE9)、CASP1(PDB ID:1RWV)、NLRP3(PDB ID:3VWE)、PIK3CG(PDB ID:2A4Z)、AKT1(PDB ID:4GAH)、TLR4(PDB ID:3FXI)、TLR7(PDB ID:5T1S)、TLR9(PDB ID:5WYX)为例,对靶点蛋白和化学成分进行分子对接结果分析,验证连花清瘟胶囊化学成分与靶点蛋白的作用。配体与受体间低能量的稳定构象预示着二者间有较大的作用可能性。一般以结合能≤-5 kJ/mol或Total Score值≥5.0作为筛选标准。本文以SYBYL-X 2.1.1对接软件进行分子对接,获得Total Score值(表1)。分子对接结果表明,MOL000522、MOL001495、MOL001494等83个化学成分与MAPK1、IL6、HSP90AA1等12个靶点蛋白的Total Score值≥5.0。Total Score值≥9.0的代表性核心活性成分与靶点蛋白分子对接模式(图6)。