《表6 引物605F/605R与目标和非目标片段错配位点Table 6 Mismatch sites between 605F/605R primers with target fragments a

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《滇池水域硅藻DNA多态性检验引物的筛选》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

本文针对滇池水域的硅藻运用Primer Premier5.0软件设计引物，通过人工筛选获得引物605F/605R、467F/467R。引物605F/605R与五类目标扩增类群存在1位碱基错配，与非目标扩增类群存在较多位点错配；引物467F/467R与目标扩增类群无错配位点，与非目标扩增类群错配位点相对较少（表6~7）。从理论上分析，引物605F/605R相对467F/467R其特异性较强敏感性略差。而测序结果显示，四对引物都能扩增得到硅藻18sr DNA片段。引物605F/605R的扩增效率最高，硅藻检出率74%，检出5类硅藻；引物467F/467R硅藻检出率约56%，检出2类硅藻；引物18s F/18sR、A145F/Dia516R硅藻检出率明显偏低；并且18s F/18sR克隆子载体引物扩增测序的效率明显低下，可能与其片段长度偏长不适合挑取菌落直接进行PCR检测有关。综上，引物605F/605R敏感性及特异性明显优于其余3对引物。