《表3 WT_TBM体系和P197S_TBM体系的氨基酸残基能量分解项》
进一步通过计算单个氨基酸能量以明确各氨基酸残基对分子亲和力的贡献。表3列出能量贡献值接近或大于1.00 kcal/mol的氨基酸残基。WT_TBM体系中能量贡献突出的氨基酸残基由大到小为:Arg286>Met247>Gly421>Leu246>Trp417,其中Arg286的能量贡献分项最大的是静电作用力(ΔEele=-29.60 kcal/mol)。P197S_TBM体系中能量贡献突出的氨基酸残基由大到小为:Arg70>Arg286>Leu418>Gly422>Ser419>Leu423>Gly421>Trp417>Ser420>Leu225,其中Arg70的能量贡献分项最大的是静电作用力(ΔEele=-41.54 kcal/mol),对复合物体系能量贡献位列第一,能量贡献占表3所列氨基酸总能量的55.2%。突变后,亲和力贡献大的氨基酸数量由5个增至10个。值得一提的是,WT_TBM体系中Arg70的自由能贡献低于1.00 kcal/mol,仅为-0.76 kcal/mol,突变后增加至-12.81 kcal/mol,主要体现为静电作用能量的大幅增加,由原来的0.79 kcal/mol转变为-41.54 kcal/mol,由不利于结合的作用转变为促进结合。对比2个体系还可看出,突变后417~423位氨基酸变成较集中贡献能量的氨基酸团。
图表编号 | XD00186109800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.09.30 |
作者 | 赵奇、邓培渊、郭运宏、陈丽培、罗青 |
绘制单位 | 郑州师范学院生命科学学院、郑州师范学院生命科学学院、郑州铁路职业技术学院建筑工程系、郑州师范学院生命科学学院、郑州师范学院生命科学学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |