《表2 2B基因型和1E基因型风疹病毒(RV)代表株》
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《福建省2015~2018年风疹病毒分子流行病学特征》
88株福建1E基因型RV株与国内外35株1E基因型RV代表株(表2)构建系统进化树(图3)。结果显示,全球1E基因型RV存在6个进化分支(Lineage 0~5),在Rivailler P等[8]划分的5个进化分支(Lineage 0~4)上出现了新的进化分支Lineage 5,包括Lineage 5a和Lineage 5b亚支。Lineage 5分支同Lineage 0~4分支核苷酸遗传距离为0.011~0.050,氨基酸遗传距离为0.012~0.042。福建1E基因型RV毒株同2018年部分日本RV毒株共同位于Lineage 5b分支,组内核苷酸遗传距离为0.001~0.002,氨基酸遗传距离是0.001~0.002。与其相近的Lineage 5a分支RV,分布在中国香港、马来西亚、日本等地,两亚支的核苷酸遗传距离为0.012~0.019,氨基酸遗传距离为0.012~0.018。2009年福建RV株同国内其他1E基因型RV株共位于Lineage1分支,与Lineage 5b分支组间核苷酸遗传距离为0.035~0.050,氨基酸遗传距离为0.030~0.042。
图表编号 | XD00182557500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.11.01 |
作者 | 陈致飞、张苏晗、李东、张海荣、杨秀惠 |
绘制单位 | 福建省疾病预防控制中心福建省人兽共患病研究重点实验室、福建省疾病预防控制中心福建省人兽共患病研究重点实验室、福建省疾病预防控制中心福建省人兽共患病研究重点实验室、福建省疾病预防控制中心福建省人兽共患病研究重点实验室、福建省疾病预防控制中心福建省人兽共患病研究重点实验室、福建医科大学公共卫生学院教学基地 |
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